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此前多项研究表明,在SARS-CoV-2的治疗中,抗病毒药物瑞德西韦已经成为有前途的候选药物。瑞德西韦通过破坏病毒的复制能力发挥作用,但其确切机制仍是一个谜。芝加哥大学普利兹克分子工程学院(PME)的研究人员使用先进的计算模拟方法,揭示了该药物在分子水平上的作用。他们还发现,两种以相似方式起作用的药物利巴韦林和法维拉韦对病毒的结合效果则不佳。
领导这项研究的Juan de Pablo教授说:“了解瑞德西韦在分子水平上的作用很重要。现在我们看到它是有效的,而其他药物却不那么有效,它可以指导未来治疗COVID-19的努力。”结果近日发表在ACS Central Science杂志上。瑞德西韦的作用是破坏SARS-CoV-2的RNA聚合酶,该酶是病毒自我复制的关键酶。当这种酶被破坏时,病毒就不会在体内繁殖和传播。但是在患者中,该药物产生了各种各样的结果。一些临床试验表明,接受该药物的患者恢复得更快,死亡率更高,而其他试验表明,该药物并没有降低死亡率或住院时间。大流行开始以来,de Pablo和他的团队一直在使用先进的计算模拟系统地研究允许病毒复制或感染细胞的不同蛋白质。他们还研究了已经用于治疗其他疾病的关键候选药物,这些药物可以重新用于抑制SARS-CoV-2中的那些过程。这些模拟需要数月的极其强大的计算,最终揭示了分子水平上发生的事情。
为了更好地了解治疗方法如何破坏RNA聚合酶,de Pablo和他的小组模拟了该酶与三种已经可用的药物之间的相互作用,这些药物旨在抑制该酶:瑞德西韦,利巴韦林和法维拉韦。他们发现瑞姆昔韦与病毒牢固结合,但利巴韦林和法维拉韦结合效果不佳。他们还发现瑞姆昔韦破坏了病毒的蛋白质复合物的稳定性,也降低了其复制能力。
de Pablo说,现在的模拟表明该药物应该在分子水平上起作用,因此科学家可以集中精力寻找更好的策略来更有效地释放该药物。此前,该小组使用计算分析来揭示药物依布硒仑如何与病毒的主要蛋白酶或MPro结合。现在,该小组还正在研究不同药物对不同蛋白质的作用机理,目的是创建分子靶标的完整图景。de Pablo说:“我们看到这种病毒并没有消失,实际上已经开始变异。因此寻找最佳疗法和最佳疗法的努力必须继续下去。”如有需要,请咨询海外医疗医学顾问:或扫码添加下方微信,我们将竭诚为您服务!
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