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从现在的临床研究来看，结直肠癌的发病原因仍然不是特别清楚，发病机制也更不了解，目前认为，结直肠癌的发生是由于环境，遗传，饮食习惯等等多种因素协同作用的结果。饮食因素与结直肠癌的发生关系密切，比如说缺乏微量元素与维生素，低纤维饮食，高脂肪，高蛋白饮食，都是大肠癌的危险因素。遗传因素在结直肠癌发病中起到重要作用，比如说家族性腺瘤性息肉病百分之百的会发生癌变。另外亚硝胺以及化合物是导致结直肠癌，最重要的化学致癌物。除此之外，溃疡性结肠炎，克罗恩病，大肠腺瘤基本上也是容易引起结直肠癌。
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