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二型糖原累积病的治疗，首先是早期的预防，在出生前可以做羊水脱落细胞酶的测定，作为产前诊断。如果确诊后在出生以后选择高蛋白饮食和脂质体静注。目前糖原累积病二型的治疗是没有特殊治疗方法。由于其糖代谢途径异常，所以饮食控制无效，在患儿出现临床症状时，只需要对症使用药物治疗。在临床上现在也处于一种探索该病的基因治疗，往往已经取得一定的效果，但是还没有进入临床研究，所以只能够对症处理，这样能够延长生存时间。
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