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纹状体中多巴胺与乙酰胆碱两大递质系统的功能相互拮抗，两者之间的平衡对基底节运动功能起着重要的调节作用。帕金森病中，纹状体多巴胺水平显著降低，造成乙酰胆碱系统功能相对亢进，这种递质失衡与皮质-基底节-丘脑-皮质环路活动紊乱和肌张力增高、动作减少等运动症状的产生密切相关。中脑-边缘系统和中脑-皮质系统的多巴胺水平显著降低，是智能减退、情感障碍等高级神经活动异常的生化基础和来源。
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