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线粒体脑肌病患者能存活的时间因人而异，目前并没有确切的统计数据，线粒体脑肌病的预后与发病年龄和临床表现密切相关，发病年龄越早、临床症状越多则预后越差。通常情况下，线粒体脑肌病呈慢性进行性进展，临床表现是非常复杂多样的，主要累及骨骼肌和中枢神经系统的脑组织。线粒体脑肌病分为不同的类型，如果是慢性进行性眼外肌麻痹，病人不伴有肢体和咽喉部的无力，病人的存活能达到十几年，但如果伴有咽喉部以及呼吸肌的无力，有可能病人只能存活数年或者5-6年，死亡率并没有明确确切的统计。出现视网膜色素变性、心脏传导阻滞和慢性进行性眼外肌麻痹三联征的表现，这样的病人可能在20岁之前死于心脏病。MELAS综合征的病人常常伴有偏瘫、偏盲以及反复癫痫发作、智力下降，随着病情的逐渐加重，脑萎缩会比较明显，一般这样的病人存活的几率大概是5-6年。而MERRF综合征主要特征为肌阵挛性癫痫发作、小脑性共济失调，出现智力障碍和四肢近端的无力，一般在儿童期发病，存活期大约为十几年。日常生活中注意给予高热量、高蛋白、高碳水化合物、低脂肪、易消化的饮食，需要适当进行肢体运动锻炼，经常活动躯体的各个关节，但活动强度和幅度不可过大。
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